цитозольний ізоцитрат дегідрогеназа в людях, мишах і польовках та філогенетичний аналіз їх ферментної родини
антон некрутенко, * дЕвид M. хіліс, † джон с. паттон,* роберт д. бредлі,* і роберт дж. бейкер*
* Факультет біологічниих наук, Texas Tech University, Texas 79409, USA
†
Факультет Зоології та Інститут Клітинної и Молекулярної Біології, University of Texas at AustinАбстракт. В цій праці ми представляємо кДНК послідовності цитозольного НАДП-залежного ізоцитрат дегідрогеназа для людей, мишей і двох видів польовок (Microtus mexicanus и Microtus ochrogaster). Виведені з цих видів послідовності амінокислоти показують високий рівень збереження послідовності амінокислоти, якє можна порівняти з важкою цепью міозіна β , і розділяють відомі структурні характеристики. Фермент Caenorhabditis elegans, який був раніше визначений як протеїн схожий з ізоцитратом дегідрогенази, найбільш вірогідно є цитозольний НАДП-залежний ізоцитрат дегидрогеназа ферментний еквівалент, базуючись на схожесті амінокіслоти з ферментами ссавців і філогенетиному аналізі. Ми також вважаємо, що цитозольний НАДП-залежний ізоцитрат дегидрогеназа охарактеризований на основі люцерни,сойових бобів та евкаліпта найбільш вірогідно є цитозольними ферментами. Філогенетичне дерево різних ізоцитрат дегідрогеназа від еукаріотних джерел показало, що незалежне копіювання генів могло дати основу цитозольним і мітохондріальним формам НАДП-залежного ізоцитрат дегидрогеназа у тварин і грибів. Статистична підтримка не була знайдена для гіпотези про те, що мітохондріальні і цитозольні форми ферментів є ортологічними в цих групах. Надається можливий сценарій еволюції НАДП-залежного ізоцитрата дегидрогеназа.