цитозольный изоцитрат дегидрогеназа в людях, мышах и полевках и филогенетический анализ их ферментного семейства 

антон некрутенко, * дэвид M. хиллис, джон с. паттон,* роберт д. бредли,* и роберт дж. бейкер*

* Факультет биологических наук, Texas Tech University, Texas 79409, USA

Факультет Зоологии и Институт Клеточной и Молекулярной Биологии, University of Texas at Austin

Абстракт. В этой работе мы представляем кДНК последовательности цитозольного НАДП-зависимого изоцитрат дегидрогеназа для людей, мышей и двух видов полевок (Microtus mexicanus и Microtus ochrogaster). Выведенные из этих видов последовательности аминокислоты показывают высокий уровень сохранения последовательности аминокислоты, которые сравнимы с тяжелой цепью миозина β , и разделяют известные структурные характеристики. Фермент Caenorhabditis elegans, который был ранее определен как протеин схожий  с изоцитратом дегидрогеназы, наиболее вероятно является  цитозольный НАДП-зависимый изоцитрат дегидрогеназа ферментный эквивалент, основываясь на схожести аминокислоты с ферментами млекопитающих и филогенетическом анализе. Мы также предполагаем, что цитозольный НАДП-зависимый изоцитрат дегидрогеназа охарактеризованные на основе люцерны, соевых бобов и эвкалипта наиболее вероятно являются цитозольными ферментами. Филогенетическое дерево различных изоцитрат дегидрогеназа от эукариотных источников показало, что независимые копирования генов могли дать основу  цитозольным и митохондриальным формам  НАДП-зависимого изоцитрата дегидрогеназа у животных и грибов. Статистическая поддержка не была найдена для гипотезы о том, что митохондриальные и цитозольные формы ферментов являются ортологическими в этих группах. Предлагается возможный сценарий эволюции НАДП-зависимого изоцитрата дегидрогеназа.

[Публикации]